歷年獲獎名單 Lists of Award Winners
| 年度 | 獎項 | 姓名 | 單位 |
| 2010 | 青年學者研究獎 | 陳月枝 | 國立交通大學 |
| 2011 | 優秀學者研究獎 | 陳玉如 | 中央研究院 |
| 青年學者研究獎 | 王亦生 | 中央研究院 | |
| 2012 | 優秀學者研究獎 | 陳仲瑄 | 中央研究院 |
| 青年學者研究獎 | 賴建成 | 國立中興大學 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 曾美郡 | 中央研究院 | |
| 2013 | 優秀學者研究獎 | 謝建台 | 中山大學 |
| 青年學者研究獎 | 陳逸然 | 中央研究院 | |
| 青年學者研究獎 | 彭文平 | 東華大學 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 李慧華 | 高雄醫學大學附設中和紀念醫院 | |
| 2014 | 優秀學者研究獎 | 邱繼輝 | 中央研究院 |
| 青年學者研究獎 | 陳頌方 | 台灣師範大學化學系 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 翁英明 | 行政院環保署環境檢驗所 | |
| 2015 | 優秀學者研究獎 | 凌永健 | 國立清華大學 |
| 青年學者研究獎 | （從缺） | ||
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 林俊利 | 中央研究院 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 黃聖聿 | 明生生物科技股份有限公司 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 潘復華 | 行政院環保署環境檢驗所 | |
| 2016 | 優秀學者研究獎 | 孫毓璋 | 國立清華大學 |
| 青年學者研究獎 | 陳朝榮 | 中國醫藥大學中西醫結合所 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | （從缺） | ||
| 2017 | 獎章 | 何國榮 | 國立臺灣大學 |
| 優秀學者研究獎 | （從缺） | ||
| 青年學者研究獎 | 陳怡婷 | 長庚大學生物醫學系 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 李福安 | 中央研究院生物醫學研究所 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 楊舒秦 | 新北市政府衛生局 | |
| 2018 | 獎章 | 李茂榮 | 國立中興大學 |
| 優秀學者研究獎 | 陳淑慧 | 國立成功大學 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 方銘志 | 衛生福利部食品藥物管理署 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 周繼中 | 貞觀生醫科技股份有限公司 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 林淑妤 | 中央研究院 | |
| 2019 | 獎章 | 謝建台 | 國立中山大學 |
| 優秀學者研究獎 | 倪其焜 | 中央研究院 | |
| 優秀學者研究獎 | 陳皓君 | 國立中正大學 | |
| 青年學者研究獎 | 郭錦樺 | 國立台灣大學 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 王瓊棋 | 國立清華大學 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 黃銘偉 | 歐陸食品檢驗 | |
| 2020 | 獎章 | 陳玉如 | 中央研究院 |
| 優秀學者研究獎 | ( 從缺 ) | ||
| 青年學者研究獎 | 徐丞志 | 國立台灣大學 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 李德仁 | 台灣安捷倫科技股份有限公司 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 宋哲明 | 台灣檢驗科技股份有限公司 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 尤譽姍 | 台中市食品藥物安全處 | |
| 2022 | 獎章 | 廖寶琦 | 國立成功大學環境醫學研究所 |
| 優秀學者研究獎 | 余兆松 | 長庚大學分子生物學科 | |
| 青年學者研究獎 | 韓嘉莉 | 台北醫學大學 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 吳欣怡 | 國立台灣大學貴重儀器中心 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 張菊香 | 屏東縣檢驗中心 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 程逸軍 | 立晴儀器工程有限公司 | |
| 2023 | 獎章 | ( 從缺 ) | |
| 優秀學者研究獎 | 廖寶琦 | 國立成功大學環境醫學研究所 | |
| 青年學者研究獎 | ( 從缺 ) | ||
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 陳柏睿 | 台灣賽默飛世爾科技股份有限公司 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 劉育閔 | 台灣杜邦股份有限公司 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 鄭思齊 | 中央研究院農業生物科技研究中心 | |
| 2024 | 獎章 | 賴建成 | 國立中興大學分生所 |
| 優秀學者研究獎 | 陳逸然 | 中央研究院農業生物科技研究中心 | |
| 青年學者研究獎 | 陳珮珊 | 國立台灣大學毒理所 | |
| 青年學者研究獎 | 蔡伊琳 | 國立台北醫學大學 生物化學暨細胞分子生物學科 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 許全智 | 中研院植物暨微生物學研究所 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 詹舜安 | 台灣安捷倫科技股份有限公司 | |
| 優秀質譜技術從業人員獎 | 劉秀娟 | 法務部法醫研究所 |